上海市中医医院嘉定院区位于嘉定区马陆镇，东至澄浏中路，西至兆年路，南至荣联路，北至乐宁路，占地69126平方米，总建筑面积112582平方米。新院区设计的过程中，充分考虑患者需求，宽敞明亮的候诊和就医环境，人性化的布局设置，为患者和家属提供温馨、舒适、安心的就医体验。
嘉定院区共有约650张床位，一期开设约355张床位，血透中心、ICU、内镜中心、大型放射医疗设备等一系列现代化设施设备也均已进驻。
目前，上海市中医医院所有临床科室悉数在嘉定院区开诊，国医大师、全国名中医、上海市名中医及高级职称专家全部出诊。医院党委书记陆嘉惠表示，医院已经做好进一步提升服务能级，加快床位和诊区开放的准备，年内全面实现嘉定院区床位和诊疗区域全部开放，为嘉定、上海市西北区域乃至长三角范围内的群众提供更好更优质的中医药服务。
嘉定院区的启用，标志着医院正式进入“一院三址”（芷江路院区、石门路院区、嘉定院区）跨越式发展的新阶段。三个院区定位各有不同：嘉定院区定位“全” ，芷江路院区定位“精” ，石门路院区定位“名”。未来，上海市中医医院将遵照国家与上海总体战略布置，进一步提升医疗综合保障能力，为区域内百姓提供优质的中医药服务，提升百姓获得感与满意度。
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