在医院手术部里面洁净手术室和一般手术室可以并存，但要区分洁净区和非洁净区，要和一般手术部有物理隔断，洁净区和非洁净区的通风系统要分开，不能共用。
空气净化措施和常规消毒措施的关系
空气净化措施是手术部质量保证的一个基本的保障条件，用空气洁净技术对整个手术部的空气进行全面的污染控制、全过程的污染控制，还有关键部位、关键点的控制等。
如果手术室空气的消毒由空气洁净技术来保障，就不再需要其他空气消毒措施。各个国家研究表明：并不需要其他辅助措施来帮助进行洁净手术室空气的管理。
手术室地面、物表等常规消毒措施仍然是需要的，其消毒措施是卫生管理方面的内容，作为环境安全处理方面仍然可以存在，应放在医院环境物表清洁消毒管理方面去考虑。
全面净化与局部净化的关系
“全面净化”是指全部空间都要净化，而“局部净化”是指对实施操作的局部进行净化，相对来说局部净化省钱、简单。洁净手术部的建设首要选择实用、安全，据此来选择局部净化还是全面净化。全面净化的优点是全面控制，避免交叉污染的可能，在尽可能节省、节约、节能的情况下，全面净化更能快速有效的达到目的，因为手术部空间大、人员多，局部净化难以达到有效控制，所以还是建议以“全面净化”为主。
层流与洁净的关系
层流是洁净技术的最高手段，目前世界上还保留层流的只有日本的标准。层流里面灰尘最少、细菌最少，甚至可以达到0，没有灰尘就没有细菌，没有细菌就没有感染。
洁净等级越高，空气洁净程度越高，但医院内手术部位感染的原因很复杂，既有外源性感染，也有内源性感染，由空气造成的感染只占10%左右，同时，感染的发生对空气中的细菌浓度也有一定的要求，所以，手术部的空气其实不需要达到绝对的无菌，因此也就没必要投入过多的资金去建设全部的层流，我国目前普遍建设为手术台局部单向流或紊流。
负压手术室与感染类手术室的关系
《医院洁净手术部建设技术规范》中没有要求医院必须建负压手术室。
4级手术室可以做感染类或重度污染类的手术，比如非深部组织、非大器官等的感染类手术，如头外伤、车祸伤等感染手术。手术室原来使用的是紫外线等传统的空气消毒措施，现在使用的是洁净技术进行处理，只是洁净度级别低一些。
负压手术室主要针对的是通过空气传播的严重传染性疾病，如活动性肺结核、SARS等呼吸道传染病。负压手术室有它的一些特殊要求，要有独立出入口等等，避免交叉感染。各级医院应根据服务功能和医院条件选择是否建立负压手术室。
洁污分明与洁污分流的关系
对于洁净手术部，规范中要求洁污分明，不论清洁物品还是污染物品，要控制好路线，应使用密闭的清洁或无菌容器进行包装，运送设备应及时进行集中消毒处理，使之能够被掌控并保持受控状态，通过管理的不断完善与进步以后，更能体现洁污分明的有效性。
以前所谓的独立洁梯、污梯，现在已经不再强调，美国CDC也降低了手术部对此流程的要求，但对传染病、隔离病房来说还是应该严格要求洁污分流。
单走廊与双走廊的关系
规范中要求的是洁污分明而不是洁污分流，因此单走廊、双走廊都是可以的，根据实际用地情况、规模等等综合考虑。
洁净区与非洁净区的关系
洁净手术部不等于没有非洁净区，非洁净用房是为洁净手术部服务的，洁净区与非洁净区之间一定要有缓冲室或传递窗等等隔开，洁净区与非洁净区必须完全物理隔断分开。
更衣与缓冲的关系
脱衣和更衣要分开，更衣后跨入的区域应该是洁净区，更衣室可以作为缓冲室看待，或者说缓冲室可以兼作他用，更衣室作为前室，可以替代再建缓冲室从而节省空间。
独立系统与合用系统的关系
Ⅰ级、Ⅱ级和负压手术室应该是一拖一的系统，Ⅲ级、Ⅳ级可采取一拖二或一拖三，条件允许所有级别一拖一最好，提倡独立的小型机组，更加便于管理。
独立冷热源与合用冷热源的关系
手术部如果比较大，独立冷热源最好。
集中送风面积和室面积的关系
我国介于美国和德国之间，目前来看比较合适，如确因手术间增大也不建议多开风口，容易搅乱气流走向，可以采用按比率扩大的方式，如房间扩大20%，送风面积也扩大20%，来增强对周边区的控制。
新风净化与末端净化的关系
手术室净化系统主要是靠末端净化，和空调不一样，新风只有初效过滤是不行的，根据不同情况，要有高中效、亚高效过滤；新风系统标准高，可以保护末端设备使用寿命，新风净化和末端净化同等重要，只有都规范才能保证手术室的空气质量。
新风净化与系统寿命的关系
新风三道过滤是必要的，新风净化处理好，系统寿命大大延长，理论延长8、9倍，否则大大缩短，所以新风净化不是额外的负担，尽可能降低能耗，提高通风效率，实现自动化，不浪费过多劳动力最好。目前北京等若干医院已经使用了自洁型的新风机组，效果很好，目前又生产出混合型的新风机组，有待今后的推广使用。
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