自6.18特大洪灾以来，三明市立即启动自然灾害卫生应急预案，最大限度防范突发公共卫生事件。截止7月6日，受灾地区消杀面积6412万平方米，实现全覆盖;未发现灾后相关传染病疫情集聚流行苗头事件;未发生因饮用水不符合卫生要求而导致肠道疾病流行事件;未报告食物中毒苗头事件;灾民临时安置点卫生均有保障。
灾情发生后，三明市卫生局采取三大措施确保抗灾防病工作顺利进行。一是组织医疗卫生有效力量赶赴灾区。全市累计出动345支医疗救治队伍1773人次，紧急调用3辆救护车，深入灾区现场开展医疗救治工作，救治伤病员3573人次。派出卫生防疫、卫生监督718支队伍2519人次，对灾区疫情防控、环境整治、消杀灭、食品安全、饮用水安全开展指导、监督、检测、检验，确保灾区卫生防病各项工作科学、有序、有效。二是组织调拨消杀物资分发灾区。据不完全统计，省、市共下拨卫生应急经费260万元，消杀物资价值168万余元，已全部到位。三是组织开展卫生防病工作。下发《开展夏季爱国卫生运动，积极做好抗灾防病工作》的通知，制定《灾后防病技术方案》。大力开展爱国卫生运动，整治室内外环境，清除淤泥和垃圾杂物，修复厕所和其他卫生设施、清除蚊蝇孳生地。截止7月5日，灾区共组织36.9万人次开展环境卫生综合整治工作。加强卫生防病监督监测，进一步加强疾病监测和疫情报告，启动灾后相关传染病疫情“日报告、零报告”制度，全市确定8个县4个县级医院、67个乡镇卫生院作为疾病重点监测点。对泰宁、将乐、清流、沙县、建宁5县的4-7岁儿童紧急接种甲肝疫苗6247人份。在饮用水监督检测方面，累计饮用水消毒受益人口59.9万人，饮用水被毁损灾民都喝上了卫生水。在食品监督方面，派出食品卫生监督员进驻乡镇村，在受灾乡镇村、社区开展巡回监督指导工作，每天派出卫生监督队伍对灾区食堂和餐饮单位开展拉网式检查，配合工商部门做好被水浸泡食品处置工作。做好突发公共卫生事件的防控。重视临时安置点卫生防病工作，每个安置点均有临时医疗卫生点，生活饮用水符合卫生要求，生活垃圾全部日产日清。广泛开展灾后卫生防病知识宣传，向各地发放27.8万份救灾防病健康教育材料，与移动公司联合，发送灾后卫生知识短讯146万条。
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